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在谢老师工作站装 BEAGLE

具体安装时间不记得了。BEAGLE 是用 GPU 来加速分歧时间推断软件 BEAST 的,好像是谢老师和计算机系的人一起开发的。貌似当时的人弄好之后就一直没动过,还有一次跑程序时吴昊阳师兄说当时的人写程序时把随机数写死了,列出这些无非就是想吐槽可重复性之难。


beagle-lib

# epel
sudo yum install -y mesa-libGLU-devel libX11-devel libXi-devel libXmu-devel
sudo yum install -y autoconf automake libtool subversion mingw64-pkg-config java-1.8.0-openjdk-devel

# you have to disable the GPU to install ***.run
sudo systemctl set-default mutli-user.target
sudo reboot

chmod +x ***.run
sudo ./***.run

sudo ln -sr /usr/local/cuda/lib64 /usr/local/cuda/lib 

install BEAGLE

sudo systemctl set-default graphical.target
sudo reboot

./autogen.sh
./configure --with-opencl=/usr/local/cuda-9.1
sudo make clean
sudo make install
make check

beast -beagle_info

当时一直不知道为何会失败,花了快两个小时才意识到,既然 BEAGLE 利用显卡,可能要把显卡打开才能编译。